教育部于2021年最后一天公布2021/2022学年第三学期全国学校运作指南，让各校有所遵循。此措施适用于与教育部下小学平级的所有私立学校和国际学校。
1月9日（A组学校）或10日（B组学校）开学时，小学一、二、六年级的学生全体返校上实体课。三、四、五年级的学生则继续维持分组轮流上课。
已经完成接种疫苗的中学预备班、中四、中五及中六、大学预科班学生、国际文凭大学预科课程（IBDP）和国际考试班，也将在全面返校上实体课。
惟此措施适用于学生接种率超过90%或以上的学校，接种率低于90%的学校还是会采用轮班制。
教育部将会在每周三公布学生接种率尚未达到90%的学校名单，任何已经达成90%接种率的学校都将会被除名，并可以在接下来的周日或周一全面返校上课。”
而中一、中二和中三学生也继续维持分组轮流上课。
全面返校的还包括学生人数少于300人的学校学生，以及免费食物补助计划的受惠学生。
全宿制学校，其中四、中五及中六、大学预科班学生、国际文凭大学预科课程（IBDP）和国际考试班学生可全面返校上课。而中一、中二和中三学生则按照课程表居家学习。
技职学院不须轮流上课
i. 大马技职证书
ii.大马技能证书
iii. 国家双向培训课程
iv. 大马技职文凭
大学预科班不须轮流上课
i. 四学期制课程 -第二学期及第四学期的学生
ii. 两学期制课程 -第二学期的学生
师范学院不须轮流上课
i. 一年预科课程（PPISMP）
ii. 教师学士课程（PISMP）
iii. 大学资格教育文凭课程
iv. 大马师范文凭课程
v. 增加主修课程（PITO）
教育部也批准校服已不合身的学生，穿著整齐返校上课。
若家长或监护人选择让孩子不返校上课，缺席并不会被纪律处分，惟家长或监护人必须致函通知校方以进行记录。
针对涉及水灾的教育机构，教育部将继续监督及更新受到水灾影响或是充作疏散中心的学校名单。进一步详情将会在2022年1月3日公布。
